Schemes означава 'схеми' или 'заговори', често с негативен оттенък, подсказващ хитрост или манипулация.
В песента, Майкъл Джексън пее за "Her schemes and plans" (Нейните схеми и планове), описвайки как Били Джийн използва хитри стратегии, за да го заблуди и да го обвини, че е баща на детето ѝ. Тази дума е ключова за разбирането на драмата и напрежението в историята на песента.
„Billie Jean“ не е просто песен, а направо музикална драма в три минути! Майкъл Джаксън ни разказва историята за една среща с ослепителна жена, която той описва като „кралица на красотата от филмова сцена“. Тя приковава всички погледи, докато танцува, но зад блясъка се крие нещо по-сложно. Разказвачът си спомня съветите на майка си: „Внимавай кого обичаш“ и „Внимавай какво правиш, защото лъжата се превръща в истина“. Тези думи се оказват пророчески.
Изведнъж историята се превръща в напрегнат трилър. Жената, Били Джийн, твърди, че разказвачът е баща на детето ѝ. Той обаче категорично отрича с емблематичните думи:
Billie Jean is not my lover She's just a girl who claims that I am the one But the kid is not my son
Песента е вдъхновена от реални преживявания на Майкъл с обсебени фенове и улавя усещането за параноя и капан, когато славата се сблъсква с лъжливи обвинения. Тя е предупреждение за тъмната страна на известността и колко е важно „винаги да мислиш два пъти“.