Refrain kelimesi, bir şeyi yapmaktan kendini alıkoymak, sakınmak veya kaçınmak anlamına gelir. Genellikle olumsuz bir eylemden uzak durmak için kullanılır.
Şarkıda, "And anytime you feel the pain, hey Jude, refrain" (Ve ne zaman acı hissetsen, hey Jude, sakın) dizesinde, Jude'a acı hissettiğinde kendini kötü hissetmekten veya olumsuz düşüncelere kapılmaktan kaçınması öğütlenir. Bu, şarkının genelindeki teselli edici ve umut veren mesajını pekiştiren güçlü bir kelimedir.
The Beatles'dan "Hey Jude", bir arkadaşın başka bir arkadaşına verebileceği en iyi tavsiyelerden biri gibi. Şarkı, adından da anlaşılacağı gibi, Jude adında birine sesleniyor ve ona cesaret veriyor. Şarkıcı, Jude'a "Take a sad song and make it better" (Hüzünlü bir şarkı al ve onu daha iyi yap) diyerek zor bir durumu olumlu bir şeye dönüştürmesini öğütlüyor. Bu, hayatın zorlukları karşısında pes etmek yerine, onları bir başlangıç noktası olarak kullanma fikrini anlatıyor.
Şarkı boyunca Jude'a verilen tavsiyeler devam ediyor. Şarkıcı, Jude'un birini sevmekten korkmamasını söylüyor: "You were made to go out and get her" (Sen onu elde etmek için yaratıldın). Ayrıca, acıyla başa çıkma konusunda da bir öğüt var: "Don't carry the world upon your shoulders" (Dünyayı omuzlarında taşıma). Bu sözler, dertlerini tek başına üstlenmemesi gerektiğini hatırlatıyor. Şarkının sonundaki meşhur "Na-na-na" bölümü ise adeta herkesin katılabileceği, umut dolu bir marşa dönüşüyor.