Uncertainty significa 'incerteza' ou 'indecisão'. É uma palavra que descreve um estado de dúvida ou falta de confiança sobre algo, especialmente sobre o futuro.
Na canção, a banda Linkin Park usa "uncertainty" para expressar a dificuldade de lidar com as consequências das suas ações e a falta de clareza sobre como seguir em frente. A frase "With the hands of uncertainty" (Com as mãos da incerteza) personifica a incerteza como uma força que molda as suas ações, tornando-a uma escolha de palavra poderosa e evocativa.
Em "What I've Done", os Linkin Park exploram o desejo profundo de redenção e de começar de novo. A letra descreve uma despedida simbólica, um adeus a uma versão passada de si mesmo, construída sobre "mil mentiras". O narrador não procura desculpas, mas sim misericórdia para "lavar" os seus erros passados. É uma canção sobre fazer as pazes com o passado e a vontade de limpar a ardósia, mesmo que o futuro seja incerto.
O tema central é a auto-confrontação e a transformação pessoal. O cantor expressa a determinação de "enfrentar-me a mim mesmo" para apagar o que se tornou. No final, a canção evolui de um pedido de perdão para um ato de auto-perdão. A decisão de "começar de novo" e "perdoar o que fiz" marca o ponto de viragem, transformando a dor e o arrependimento numa promessa de um futuro diferente.