Apologize betekent 'excuses aanbieden' of 'je verontschuldigen'. Het is het centrale thema van het nummer en een woord dat je vaak tegenkomt in emotionele contexten.
In dit nummer van Timbaland en OneRepublic draait het hele verhaal om het te laat zijn met excuses. De zanger zingt: "It's too late to apologize", wat de kern van de boodschap vormt: soms is het gewoon te laat om dingen goed te maken, hoe oprecht je excuses ook zijn.
In "Apologize" van Timbaland en OneRepublic horen we het verhaal van iemand die het breekpunt in een relatie heeft bereikt. De zanger voelt zich alsof hij aan een touw hangt, "tien voet boven de grond", volledig overgeleverd aan de grillen van zijn partner. Er is een pijnlijk patroon: de partner zegt hem nodig te hebben, om hem vervolgens weer neer te halen. De liefde die ooit een "vurig rood" was, is nu aan het veranderen in een koud, verdrietig "blauw".
Ondanks dat de zanger zijn partner nodig had "zoals een hart een hartslag nodig heeft", is er iets veranderd. Wanneer de partner opnieuw spijt betuigt, "als een engel", is het te laat. De zanger heeft zijn stem gevonden en weigert de verontschuldiging te accepteren. De boodschap is duidelijk en krachtig: de schade is aangericht en er is geen weg meer terug. Het is simpelweg "te laat om je te verontschuldigen".