Atonement bedeutet 'sühnen' oder 'wiedergutmachen'. Es ist ein starkes Wort, das man nicht oft in Pop-Songs hört und eine tiefe religiöse oder moralische Bedeutung hat.
Im Lied singt David Kushner: "Two sinners can't atone from a lone prayer" (Zwei Sünder können nicht durch ein einziges Gebet sühnen). Es drückt die Idee aus, dass bestimmte Handlungen oder Sünden eine tiefere Wiedergutmachung erfordern, als nur ein einfaches Gebet. Es ist ein zentrales Thema im Lied, das von Schuld, Vergebung und dem Kampf zwischen Gut und Böse handelt.
In „Daylight“ nimmt uns David Kushner mit auf eine Reise in einen tiefen inneren Konflikt. Der Song beschreibt das Gefühl, zwischen zwei Extremen gefangen zu sein: dem Verlangen nach etwas, das sich gut anfühlt, und dem Wissen, dass es eigentlich falsch ist. Es geht um eine verbotene Liebe oder eine zerstörerische Leidenschaft, die der Sänger gleichzeitig liebt und hasst. Die Zeile „You and I drink the poison from the same vine“ (Du und ich trinken das Gift vom selben Weinstock) verdeutlicht, dass diese Erfahrung geteilt wird und beide Beteiligten in diesem Kreislauf gefangen sind.
Der Song ist voller religiöser Anspielungen und handelt von Sünde, Schuld und dem Wunsch nach Vergebung. Der Sänger kämpft mit seinem Gewissen und versucht, dem „Licht“ zu folgen, wird aber immer wieder von der „Dunkelheit“ angezogen. Das „Daylight“ (Tageslicht) wird hier zum Symbol für Wahrheit, Moral und Urteil – all die Dinge, vor denen sich die beiden Liebenden verstecken. Sie leben ihre Sünden im Verborgenen aus und rennen vor der Wahrheit davon, die ans Licht kommen würde, wenn der Tag anbricht.