Whispered significa 'susurrado', el acto de hablar muy suavemente usando el aliento en lugar de la voz. Es una palabra muy poética que captura la esencia de la canción.
En la letra, las verdades más profundas son "whispered in the sound of silence" (susurradas en el sonido del silencio). Esto crea una imagen poderosa: los mensajes importantes no se gritan, sino que se encuentran en los momentos y lugares más silenciosos, esperando ser escuchados por quien preste atención.
Esta canción empieza con una de las frases más famosas de la música: "Hello darkness, my old friend" [Hola oscuridad, mi vieja amiga]. El cantante nos sumerge en un mundo solitario, donde camina por calles frías hasta que una luz de neón lo ciega. Lo que ve es una multitud de gente que no se comunica de verdad. Son "people talking without speaking" [gente que habla sin decir nada] y "people hearing without listening" [gente que oye sin escuchar]. Es una crítica muy fuerte a cómo la gente a menudo no se conecta de manera profunda, prefiriendo quedarse en el superficial "sonido del silencio".
El narrador intenta advertir a la gente, diciéndoles: "'Fools,' said I, 'You do not know / Silence like a cancer grows'" ['Tontos', dije, 'No sabéis / que el silencio crece como un cáncer']. Pero sus palabras no tienen efecto y caen como "silent raindrops" [gotas de lluvia silenciosas]. Al final, la gente prefiere adorar al "neon god they made" [dios de neón que crearon], un símbolo de la tecnología y la comunicación masiva y vacía. La canción termina con una idea poderosa: la verdadera sabiduría, "the words of the prophets" [las palabras de los profetas], no está en los grandes anuncios, sino escrita en lugares humildes como "on the subway walls" [en las paredes del metro] y susurrada en el mismo silencio que todos ignoran.